《九州缥缈录》是江南创作的一部奇幻小说，讲述了北陆青阳部的少年吕归尘、徐渡然等人在乱世中的成长与奋斗。这部作品中的人物关系错综复杂，涉及了许多情感纠葛。关于故事结局中谁在一起的问题，我们可以简单地总结如下：

1. 吕归尘与羽然：作为小说的主要人物之一，吕归尘和羽然之间的感情线贯穿始终。两人经历了许多困难与挑战，最终相互扶持，共同面对未来的风雨。虽然小说并未明确描述他们结婚的情节，但读者普遍认为两人是走到了一起。

2. 呼笃与苏瑾深：呼笃是青阳部的勇士，而苏瑾深则是青阳部首领的儿子。两人之间有着深厚的感情，但因为种种原因未能在一起。不过，在故事的最后，他们还是选择了对方，共同面对生活的艰辛。

3. 其他配角：对于其他角色如阿苏勒与羽然、阿苏勒与白胤等人的感情线，则没有明确的结果，留给读者无限遐想的空间。

需要注意的是，《九州缥缈录》系列还有后续的作品，比如《九州缥缈录Ⅱ：黑暗之潮》，因此部分人物的关系可能在后续的故事中有进一步的发展。此外，由于该作品改编自网络连载的小说，不同版本或改编版本可能会对结局有所调整。因此，在讨论具体情节时，建议参考官方出版物或作者的正式解释。